Doce años atrás, el zorro demonio de nueve colas (Kyūbi, 九尾) atacó la Villa Oculta de la Hoja (Konoha gakure no sato, 木ノ葉隠れの里) hasta que uno de sus líderes (el cuarto Hokage, 四代目火影) lo venció sacrificando su propia vida para sellar al zorro en el interior de un niño recién nacido. El nombre de aquel niño era Naruto Uzumaki.

El cuarto Hokage (Yondaime) fue recordado como héroe por sellar al zorro de nueve colas, él quería que Naruto fuera recordado como un héroe también, pero éste creció con el desprecio de su pueblo, ya que lo veían tan sólo como el zorro que había asesinado a sus familias y destruido su pueblo.

Naruto creció como un huérfano, sin amigos o reconocimiento. Él no podía hacer volver a sus padres o forzar a la gente a ser sus amigos, así que buscó reconocimiento del único modo que conocía, con travesuras. Pero eso iba a cambiar pronto. Naruto está a punto de realizar el examen de graduación de la academia ninja – una puerta a acontecimientos y gente que cambiarán y definirán su mundo y su camino de ninja para el resto de su vida.

Naruto mantiene un equilibrio entre drama y comedia. Se basa en el crecimiento de Naruto y sus amigos como ninjas dando énfasis en las interacciones entre éstos y cómo el pasado ha influenciado sus personalidades. Naruto ha encontrado dos amigos y compañeros de su misma edad, Uchiha Sasuke quien también es su eterno rival y Haruno Sakura de quien está enamorado, aunque Sakura está enamorada de Sasuke. Los tres forman el Equipo 7 bajo la guía del experimentado jounin sensei Hatake Kakashi. Cada uno con un sueño individual los llevará a aprender nuevas habilidadas y técnicas para lograr su objetivo.

Pero Sasuke va buscando venganza, el pertenece al clan Uchiha el cual mato y exterminó su hermano mayor Uchiha Itachi, y anda buscando poder, necesita conseguir el sharigan de su hermano (Mangekyou Sharingan!)para ser mas fuerte que el pero hay un requisito, tiene que matar a su mejor amigo(naruto); y Orochimaru(el malo) le ofrece poder a cambio de su cuerpo y naruto junto a sus amigos se embarcan en una mision para salvarlo pero no lo consiguen.